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: Un logiciel de visualisation 3D sous licence CeCILL

Posté par Damien Caliste (page perso, ). Modéré le 23 septembre 2005.
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V_Sim est un logiciel libre créé par plusieurs chercheurs du CEA (Commissariat à l'Énergie Atomique) permettant de représenter en 3D des agencements atomiques. C'est un outil pratique à la fois pour les physiciens du solide et pour les chimistes car il facilite la visualisation des systèmes étudiés. Il est sortie une nouvelle version cette semaine.

Côté technique, ce logiciel est basé sur GTK pour l'interface et sur OpenGl pour le rendu 3D. Il fonctionne aussi bien sous Linux que sous Windows et sa licence est la CeCILL.

Au niveau des fonctionnalités, V_Sim se rapproche de Rasmol, logiciel bien connu de représentation de molécules. Il apporte néanmoins de nouvelles possibilités comme celle d'enchaîner l'affichage de plusieurs fichiers à la suite, créant un petit film animé à l'écran durant lequel les rotations de la caméra restent possibles. D'autres fonctions sont présentées dans la suite de l'article.

> Lire la suite (18 commentaires, moyenne: 2,2).   [dépêche : 1029 caractères]

Dans V_Sim, les atomes peuvent être représentés par des sphères ou des cubes et la dernière version ajoute la possibilité de représenter des spins atomiques par des petites flèches.

Entre les atomes, on peut tracer des liaisons. On peut aussi tracer des plans pour matérialiser des plans cristallins particuliers ou encore tracer des volumes correspondant aux iso-surfaces d'un champ scalaire.

En plus de la simple représentation à l'écran, il est possible d'interagir avec le système dessiné en faisant tourner la caméra autour, en zoomant ou en changeant la perspective. On peut obtenir des informations sur les distances et les angles entre les éléments du système ou encore effectuer des translations périodiques, masquer certaines parties...

V_Sim est disponible sous forme de sources (le logiciel est programmé en C) ou de binaires compilés pour Windows ou pour Debian (machines i386 et Alpha). On trouve aussi un répertoire « examples » dans l'archive permettant de tester rapidement les différentes possibilités.

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Les captures

Posté par L () le 23/09/2005 à 16:04. (lien). Évalué à 6.

Chacun appréciera les goûts de couleurs des chercheus dans les captures présentées : de l'orange vif au vert fluo dans toute l'interface graphique, je crois qu'on peut dire qu'ils ont embauchés jacky :)

il y a aussi vmd, pymol...

Posté par tru () le 23/09/2005 à 16:07. (lien). Évalué à 4.

http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
http://pymol.sourceforge.net/

64bits ?

Posté par brunus (page perso, ) le 23/09/2005 à 17:30. (lien). Évalué à 3.

Rasmol est un vieux projet, il ne semble pas être possible de la compiler sur archi 64 bits (dixit...des gens qui on essayé...).

Le projet qui a succédé à rasmol n'a malheureusement pas été porté sous *nix/linux. Seule une version windows est disponible...le truc s'appel "protein explorer"

Je n'ai pas machine 64 bits sous la main mais j'aurai besoin de savoir si V_Sim est compilable sur archi 64 bits
Est ce qu'une bonne âme équipé de ce type de matos peut faire le test ?

Merci d'avance !

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Engendrer sans chercher à posséder, accomplir sans en revendiquer le mérite, guider sans dominer, telle est la vertu suprême. (attribué à Lǎo Zi, -500 av JC)

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Posté par CoinKoin () le 23/09/2005 à 19:52. (lien). Évalué à -1.

Un répertoire "Examples"... Le CEA a encore des progrès à faire en orthographe ;-) .

Enfin

Posté par 桃白白 (page perso, ) le 26/09/2005 à 11:57. (lien). Évalué à 2.

Enfin une alternative libre aux "Experts à Miami"

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